Il servizio di Gastroenterologia dell'Ospedale Giovanni XXIII di Bari si occupa della prevenzione, della diagnosi e del trattamento medico delle malattie dell'apparato gastrointestinale (esofago, stomaco, intestino tenue, colon, retto), come celiachia, allergie alimentari, colite, diverticoli, ernia iatale, gastrite, malattia da reflusso gastroesofageo e ulcere. La visita gastroenterologica ha come obiettivo l'analisi delle problematiche legate all'apparato digerente mentre la visita epatologica diagnostica eventuali patologie del fegato, della cistifellea o delle vie biliari.