Il Dipartimento di Ortopedia Traumatologia e Chirurgie Specialistiche dell'ASST Gaetano Pini-CTO, uno dei più antichi in Italia e nel mondo, si occupa di tutte specialità della ortopedia moderna: 

• la traumatologia degli arti e del bacino
• la chirurgia vertebrale dalle patologie cronico degenerative, alla scoliosi e alla traumatologia
• la chirurgia della spalla e del gomito con tecniche chirurgiche tradizionali e mini invasive
• la chirurgia della mano in campo traumatologico  e cronico degenerativo
• la chirurgia protesica dell'anca e del ginocchio per i primi impianti, le revisioni complesse e la chirurgia artroscopica
• la chirurgia del piede
• la traumatologia sportiva
• la chirurgia ortopedica pediatrica in ambito delle malattie genetiche, delle patologie malformative e della traumatologia
• la chirurgia oncologica per i tumori delle parti molli e dell'osso in ambito pediatrico e nell'adulto e la chirurgia delle metastasi

La ricerca interessa tutti gli ambiti specialistici.
La clinica ortopedica è impegnata nello studio della chirurgia personalizzata del ginocchio e nel rimodellamento osseo periprotesico nella chirurgia dell'anca.
Attività di ricerca clinica sono svolte all'interno dell'area pediatrica in collaborazione con l'Università degli Studi di Milano.
Il reparto di chirurgia della mano è impegnato nell'ambito della ricerca sulla rigenerazione nervosa e sulle tecniche di riparazione nervosa con l'Università di Torino.
La divisione di oncologia ortopedica collabora ad attività di ricerca sui tumori maligni ossei e delle parti molli (sarcomi) con la struttura di Anatomia Patologica dell'ASST Gaetano Pini-CTO e con l'Istituto Nazionale dei Tumori di Milano.